Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM71F1Q96KD3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms