Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VCPIP1Q96JH7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms