Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARF2Q96GP6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms