Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPACA9Q96E40 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms