Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HDAC11Q96DB2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms