Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TM4SF18Q96CE8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms