Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG2BQ96BY7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG2BQ96BY7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG2BQ96BY7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG2BQ96BY7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG2BQ96BY7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG2BQ96BY7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG2BQ96BY7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG2BQ96BY7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG2BQ96BY7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG2BQ96BY7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms