Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM54Q969K7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms