Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RFKQ969G6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms