Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms