Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms