Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC9Q8TBE3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms