Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST4Q8NFU0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms