Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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