Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGDNQ8NEJ9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms