Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms