Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF439Q8NDP4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF439Q8NDP4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF439Q8NDP4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF439Q8NDP4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF439Q8NDP4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF439Q8NDP4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF439Q8NDP4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF439Q8NDP4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF439Q8NDP4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF439Q8NDP4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF439Q8NDP4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF439Q8NDP4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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