Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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