Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLDN19Q8N6F1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms