Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTROBQ8N137 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms