Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOT1Q8IXI2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOT1Q8IXI2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOT1Q8IXI2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOT1Q8IXI2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOT1Q8IXI2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOT1Q8IXI2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOT1Q8IXI2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHOT1Q8IXI2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms