Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO2Q7Z6W1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO2Q7Z6W1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO2Q7Z6W1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms