Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms