Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms