Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAXIP1Q6ZW49 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms