Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms