Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC174Q6PII3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms