Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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