Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L3Q68CJ9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms