Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USPL1Q5W0Q7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms