Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CARMIL1Q5VZK9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL1Q5VZK9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms