Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms