Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRPF38BQ5VTL8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms