Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HES3Q5TGS1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms