Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms