Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms