Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDO1Q16878 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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