Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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