Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CLPPQ16740 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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