Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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