Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms