Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC6Q16204 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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