Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZIC1Q15915 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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