Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMGN3Q15651 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGN3Q15651 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HMGN3Q15651 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGN3Q15651 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms