Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms