Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX1-1Q15270 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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