Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDGFRLQ15198 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms