Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PRKD1Q15139 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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