Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDCD1Q15116 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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