Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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